Setiap lembaga atau organisasi selalu memiliki lambang/logo yang merupakan identitas dari lembaga atau organisasi yang bersangkutan. Dalam lambang tersebut tercermin filosofi yang diusung serta tujuan yang ingin dicapai. Ide pembuatan logo Pesantren Modern Ihsanul Fikri ini dicetuskan oleh Direktur Pesantren Ihsanul Fikri Al Ustadz Imam Sadzali, S.Pd.I., M.Pd. dalam rapat persiapan pendirian pondok pesantren yang dihadiri oleh Al Ustadz Koesdiharno (inisiator berdirinya pesantren), Al Ustadzah Fatin Mahdalina, S.Pd. (tim perumus), Al Ustadz Sumarsono, S.Pd., M.Eng (Tim perumus), Al Ustadz Bangun Wasito Aji, S.H.I (Tim perumus), Agus Nugroho, S.Pd. (tim perumus), dimana nama-nama tersebut merupakan Tim Pendiri Pesantren Ihsanul Fikri.
Berikut bagian-bagian dan arti dalam logo pesantren modern ihsanul fikri (IFIBS)
1. Perisai : Tanda tameng/perisai yang merupakan simbol dari usaha pesantren untuk membentengi ataupun melindungi segenap warga pesantren dari hal-hal yang dapat merusak aqidah.
2. Bulan Sabit : merupakan simbol kejayaan Islam yang rahmatallil alamin sebagai cita-cita tertinggi yang ahrus diwujudkan oleh warga pesantren.
3. Pena dan buku yang bersayap : merupakan simbol dari perangkat adab dan keilmuan sebagai sarna untuk meraih kejayaan Islam
4. Backgraund merah putih: Semangat keIndonesiaan dalam yang telah dirintis oleh para ulama’ dengan dasar rasa cinta dan kasih sayang sesama manusia.
5. Warna merah : inspirasi dari warna bendera indonesia yang bermakna keberanian dalam menegakkan yang haq dan memberantas yang bathil.
6. Warna kuning : energi positif yang dapat memacu semangat prduktifitas.
Secara umum, maksud dan tujuan dari logo Pesantren Modern Ihsanul Fikri (IFIBS) adalah sebagai pengingat bahwa lembaga berperan aktif untuk melindungi generasi muda saat belajar ilmu dan Adab agar terhindar dari hal-hal yang dapat merusak kemurnian ajaran Islam yang rahmatal lil alamin.